Diagnosen bliver typisk stillet alene på baggrund af de karakteristiske smerteforløb. Patienterne er imidlertid ofte i tvivl om smerterne skal tilskrives problemer med tænderne, og desværre er der såvel tandlæger som læger, der ikke umiddelbart er fortrolige med lidelsen, og unødige tandoperationer er desværre ikke ualmindelige.Ofte vil mistanken om sygdommen føre til henvisning til neurolog.

Selv når sygdommen er diagnosticeret kan fastlæggelse af korrekt medicinering være vanskelig, og ofte kan en henvisning til Hovedpineklinikken på Glostrup Hospital, som er specialisterne på området, være anbefalelsesværdig. Hovedpineklinikken kan også foranledige, at der udføres en såkaldt MR-skanning, for at få et underlag til vurdering af den forventede konflikt mellem en blodåre og Trigeminusnerven.